朱温从凤翔把唐昭宗接了出来，先是找昭宗请罪，对着昭宗哭的稀里哗啦的，主要就是他带着这么多人来，惊扰了昭宗的圣驾，而另一方面就是因为他没有好好保护好昭宗，让昭宗竟然被几个太监劫持到了凤翔。
而此时的昭宗自然也很明白，这不过是朱温逢场作戏罢了，而现在他和在凤翔的时候，没有什么区别，之前在李茂贞手下，现在在朱温控制之下。本质上来说他的处境并没有什么实质性的变化，甚至还可以说恶化了。
所以昭宗也对朱温和颜悦色的安慰了几句，然后就是一番嘉奖之类的，感谢了一下朱温的救驾之功。
做戏就要做全套，昭宗返回长安的时候，朱温在车驾前面带路，走了十多里。这才让他的侄子，朱存的二儿子朱友伦，也就是朱温口中的麒儿，护送昭宗返回长安。
朱温送走了皇帝之后，处理了一下善后事宜，主要就是和李茂贞虚与委蛇，随后就和宰相崔胤一起回到了长安。
就在昭宗到了长安的第二天，朱温和崔胤就来找皇帝谈话了。至于谈话的内容，先是朱温问候一下皇帝，然后皇帝感激一下朱温，说他和崔胤是匡国之功。
但是这不是重点，双方客套完了，崔胤开始说正事，那就是诛杀宦官。
至于借口，还是老一套，什么宦官误国，屏蔽上听，为非作歹，作乱犯上这之类的。反正现在宦官势力已经是兔子尾巴长不了了，崔胤怎么说都不会有人出来反对或者辩解。
昭宗心里面也是愤恨宦官，唐朝自从唐玄宗重用高力士开始，宦官权柄日盛，到了后面基本上皇帝也要听宦官的。皇帝的权利和自由受到了极大的限制，而唐昭宗自从登基开始就一直想要解决这一个问题，但是很遗憾，这个问题非但没能解决，反而愈演愈烈。但是此时朱温带着大军来了这让昭宗看到了希望。
而这一次虽然是崔胤提出来的诛杀宦官，但是背后要是说没有朱温的支持，那这说出去谁也不信，所以昭宗当即就同意了。
很快，朱温派人将皇宫里的大小太监都收拾赶紧了，而同时还下诏各地派去的监军（也是太监），都要诛杀。
这一次朝廷和朱温是打定主意要彻底灭绝宦官了，但是当时的杨行密、李克用、王建等人都没有执行这个诏令，他们随便找个死囚砍了脑袋，然后说监军已死。就这样糊弄过去了。
诛杀了宦官，这样一来，大唐后期两大难题，这一次被朱温彻底解决了。着两大难题一个是宦官专权，一个就是藩镇割据。
这里我们还要说一下唐朝的宦官为什么这么厉害，大家都应该了解，唐末和东汉末年，是有几分类似的，这里面一个相同点就是宦官专权。
但是深入一点，就会发现，唐朝的宦官比东汉末年的那几个宦官更厉害。汉朝最有名的就是十常侍，他们当时的权力之大到了可以操纵幼帝的地步，按理说这已经很厉害了，竟然能够操纵皇帝。
可是我们从本质上来分析，宦官当时凭借的还是皇帝，他们之所以能够操纵皇帝，主要靠的还是他的位置和关系而不是他们本身的能力和实力。他们的权利来自于皇帝，宦官一般在皇帝还没即位的时候就跟着，所以对于皇帝本来来说对于这些太监是十分的信任的，而这些太监长期就通过欺上，和控制皇帝身边的人员。达到长期“控制”皇帝的目的，当然这里我们说的控制，倒更像是一种诱导，只能算是一种间接的控制。
举个例子吧，宦官想要收拾一个人，他不能直接说让皇帝把那个人干掉，只能说这个人平时不检点，或者干了什么伤天害理的事，然后让皇帝处理一下。
皇帝信任宦官，而且古代臣子想要见皇帝并不是一件很容易的事情，可以说根本没有辩解的机会，然后皇帝那时候玩得正高兴，直接就交给宦官看着办了。
这就是宦官控制皇帝的一种方式。
但是到了唐末，宦官的权利来源，不仅仅局限于皇帝，他们掌握了军权，这只能让他们更加的肆意妄为，所以到了唐末宦官们更加的肆无忌惮，甚至皇帝都要看他们脸色行事。
以至于到了后来宦官能够挟持皇帝，更不用说干预皇位的继承了。
现在朱温灭掉了宦官，不论他是不是真的想为大唐除掉这个祸害，或者只是单纯的朝堂权力之争，从这个行为来看，朱温的确是有那么点贡献。
灭掉了宦官，崔胤比较高兴，因为这标志着他和宦官的争斗，最终他胜利了，宦官原本掌握的军权，虽然没到他的手里，但是他在朝堂上却是没有牵制了，可以说一手遮天。
当时接替宦官负责军权的朱友伦，这个人比较受朱温喜欢，朱温让他在长安的目的也很明显，这里相对比较平静，让朱友伦简单的历练一下，然后准备委以重用，这算是他培养的接班人之一。这里的接班人并不是接替他的位置，而是着眼于朱氏整个家族的兴盛和发展。作为朱家未来的顶梁柱之一。
此后朱温在长安进行了势力重组，崔胤作为朱温在朝廷的代言人，自然是得到了不少好处，凡是和崔胤不合